Protokol je potpisan na osnovu članova 12. i 24. Sporazuma između Vlade Republike Srbije i Vlade Republike Hrvatske o policijskoj saradnji.

Protokolom se u skladu sa do sada nezabeleženom migracionom, odnosno izbegličkom krizom, a na osnovu već usvojenih međunarodnih i drugih instrumenata koji uređuju zaštitu ljudskih prava, unapređuje stanje bezbednosti, sprečavaju nezakonite migracije, trgovina ljudima i druge nedozvoljene radnje, posebno na području uz zajedničku državnu granicu, u cilju daljeg unapređenja sistema humanitarnog prihvatanja i zbrinjavanja.